Análise Das Sequências De Nucleotídeos De Novos Subtipos De Toxinas E Proteínas De Anêmonas Do Mar Por Sequenciamento De Rna De Nova Geração

Análise Das Sequências De Nucleotídeos De Novos Subtipos De Toxinas E Proteínas De Anêmonas Do Mar Por Sequenciamento De Rna De Nova Geração

Author Boralli, Leandro Augusto Freire Autor UNIFESP Google Scholar
Advisor Kerkis, Irina Autor UNIFESP Google Scholar
Institution Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Graduate program Biologia estrutural e funcional
Abstract Sea anemones are sessile organisms that employ a venomous apparatus (preferably located in their tentacles) to produce and inoculate paralyzing toxins in their prey or to defend themselves. Our group recently contributed to the characterization of the peptidoma of 3 species of sea anemones, showing that the molecular diversity of the toxins of these organisms is much higher than expected. From the point of view of the nucleotide information obtained from anemones, few species were investigated in detail, revealing that at the moment only a small fraction of the toxic arsenal of the cnidarians was investigated. In addition, new structural proteins that occur in anemones present structural and genetic similarity to proteins of derived organisms, such as vertebrates. In this sense, we intend to analyze and compare the transcriptome of two populations of the Brazilian anemone Bunodosoma caissarum, a population of the São Paulo coast and another population located in the isolated São Pedro and São Paulo archipelago. This analysis will be done through the sequencing of new generation RNA, by the Illumina system. With this sequencing and with bioinformatics analyzes we hope to find information regarding new toxins never before studied in this species and also to analyze the differences in the expression profile between the two populations

As anêmonas do mar são organismos sésseis que empregam um aparato peçonhento (localizado preferencialmente em seus tentáculos) para produzir e inocular toxinas paralisantes em suas presas ou para defender-se. Nosso grupo contribuiu recentemente na caracterização do peptidoma de 3 espécies de anêmonas do mar, mostrando que a diversidade molecular das toxinas desses organismos é muito maior que o esperado. Do ponto de vista da informação nucleotídica obtida das anêmonas, poucas espécies foram investigadas em detalhe, revelando que no momento apenas uma pequena fração do arsenal tóxico dos cnidários foi investigado. Adicionalmente, novas proteínas estruturais que ocorrem em anêmonas apresentam uma similaridade gênica e estrutural impressionante com proteínas de organismos derivados, tal como vertebrados. Neste sentido, pretendemos analisar e comparar o transcriptoma de duas populações da anêmona brasileira Bunodosoma caissarum, uma população da costa de São Paulo e outra população localizada no arquipélago isolado São Pedro e São Paulo. Essa análise será feita através do sequenciamento de RNA de nova geração, pelo sistema Illumina. Com esse sequenciamento e com análises de bioinformática esperamos encontrar informações referentes a novas toxinas nunca antes estudadas nessa espécie e também analisar as diferenças no perfil de expressão entre as duas populações
Keywords Anemones
Bunodosoma
Toxins
Rna-Seq
Anemonas
Bunodosoma
Toxinas
Rna-Seq
Language Portuguese
Date 2017-07-31
Research area Biologia Estrutural E Funcional Aplicada
Knowledge area Biologia Celular E Molecular
Publisher Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Extent 145p.
Origin https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=5031725
Access rights Closed access
Type Dissertation
URI http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/50217

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