Estudo das acetilações da histona h4 em trypanosoma cruzi

Estudo das acetilações da histona h4 em trypanosoma cruzi

Author Ramos, Thiago Cesar Prata Autor UNIFESP Google Scholar
Advisor Schenkman, Sergio Schenkman Autor UNIFESP Google Scholar
Institution Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Graduate program Biologia Estrutural e Funcional
Abstract Histones have a series of post-translational modifications such as acetylation, methylation, fosforizações, ADP-ribosilações and ubiquitinações, that modulate access of these factors regulating replication processes, repair and recombination of DNA and transcription of mRNA. Histones are conserved in most eukaryotes. However, trypanosoma, which include protozoan parasites that early diverged during evolution, have very different histones, differing in sequence, charge and / or size when compared to their counterparts in eukaryotes. In addition, trypanosomatides have specific mechanisms of control of gene expression. In our laboratory we found that the acetylated histone 4 can be in three different lysines (K4, K10 and K14) and obtained antibodies that specifically recognize each of these modifications. Unpublished results from our group show that acetylation at K10 and K14 vary during the cell cycle and in states where there is DNA repair. In this project, we aim to understand the role of these changes, especially in K10 and K14 in Trypanosoma cruzi. For this we plan to: 1) analyze the effect of deacetylase inhibitors, 2) change the susceptibility of histone H4 expressing this modified protein in the parasite itself, 3) to evaluate the effect on the over-expression of acetylation and knockout of proteins involved in repair DNA, 4) identify acetylases and deacilases directly involved in these changes, and 5) generate lines that over-express or have decreased expression for these acetylases. Together, we hope to understand the relationship between acetylation of histone H4 and replication processes, DNA repair and transcription Trypanosoma.

As histonas apresentam uma série de modificações pós-traducionais tais como acetilações, metilações, fosforizações, ADP-ribosilações e ubiquitinações, que modulam o acesso destes fatores regulando os processos de replicação, reparo e recombinação do DNA e a transcrição de mRNA. As histonas são conservadas na maioria dos eucariotos. Entretanto, os tripanosomatídeos, que englobam protozoários parasitas que divergiram muito cedo durante a evolução, tem histonas muito distintas, diferindo em sequência, carga e/ou tamanho quando comparadas com seus homólogos eucariotos. Além disso, os tripanosomatídeos apresentam mecanismos peculiares do controle da expressão gênica. Em nosso laboratório verificamos que a histona 4 pode estar acetilada em três distintas lisinas (K4, K10 e K14) e obtivemos anticorpos que reconhecem especificamente cada uma destas modificações. Resultados ainda não publicados do nosso grupo revelam que as acetilações em K10 e K14 variam durante o ciclo celular e em estados em que há reparo de DNA. Neste projeto, temos como objetivo entender o papel dessas modificações, principalmente em K10 e K14 em Trypanosoma cruzi. Para isso pretendemos: 1) analisar o efeito de inibidores de deacetilase, 2) alterar a suscetibilidade da histona H4 expressando esta proteína modificada no próprio parasita, 3) avaliar o efeito na acetilação da super-expressão e de nocaute de proteínas envolvidas em reparo de DNA, 4) identificar acetilases e deacilases diretamente envolvidas nestas modificações, e 5) gerar linhagens que super-expressem ou tenham a expressão diminuída para estas acetilases. Em conjunto, esperamos entender a relação entre as acetilações da histona H4 e os processos de replicação, transcrição e reparo de DNA em Trypanosoma.
Keywords trypanosoma cruzi
histone
cell cycle
acetylation
dna damage
trypanosoma cruzi
histona
ciclo celular
acetilação
dano de dna
Language Portuguese
Date 2015-05-27
Published in RAMOS, Thiago Cesar Prata. Estudo das acetilações da histona h4 em trypanosoma cruzi. 2015. Tese (Doutorado) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2015.
Research area Biologia geral
Knowledge area Ciências biológicas
Publisher Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Origin https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=3585503
Access rights Closed access
Type Thesis
URI http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/48000

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