Síntese e estudo da estabilidade conformacional de s-nitrosotiós derivados de aines (anti-inflamatórios não esteróidais)

Síntese e estudo da estabilidade conformacional de s-nitrosotiós derivados de aines (anti-inflamatórios não esteróidais)

Author Reginato, Marcelo Mota Autor UNIFESP Google Scholar
Advisor Reis, Adriana Karla Cardoso Amorim Reis Autor UNIFESP Google Scholar
Institution Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Graduate program Ciência e Tecnologia da Sustentabilidade
Abstract We synthesized and carried out a conformational study of the S-nitrosothiols 2-methyl-2-(nitrososulfanyl) propyl-phenylacetate-para-substituted 9R1, derivative of propanoic 2-(4-isobutylphenyl) acid (Ibuprofen) 9R2 and 2-methyl-2-(nitrososulfanyl) propyl 2-(4-isobutylphenyl) propanoate (Naproxen) 9R3 (S-Nitrosothiols 9R1, 9R2, and 9R3): Two synthetic routes have been proposed for the synthesis of S-Nitrosothiols 9R1, 9R2, and 9R3. In Route A we used brominated intermediates and dicyclohexylcarbodiimide (DCC) as coupling reagent for esterification. In Route B the esterification with an acyl chloride is the last step in the synthetic route. Both routes resulted in good yields of the final product (~ 50%), although only Route B led to the formation of the compounds of interest. S-Nitrosothiols 9R1, 9R2, and 9R3, together with their brominated intermediates were submitted to infrared spectroscopic analysis in solvents of low dielectric constant (CCl4, CH3Cl and CH3CN). For brominated intermediates we observed the presence of two bands in the carbonyl stretch region of the group indicating the existence of two conformations. S-Nitrosothiols 9R1, 9R2, and 9R3 showed only one band in the same region in most cases. We carried out the conformational search for the compounds under study and stable conformations geometries were theoretically optimized, B3LYP DFT / G 6311 + (2df, 2p). Results obtained in the infrared analysis were confronted with the theoretical data showing good agreement with experimental results in CCl4 for isolated molecules. Calculations made using the solvent effect by the method PCM do not indicate agreement with experimental data. The lowest energy conformations of S-Nitrosothiols 9R1, 9R2, and 9R3 and brominated intermediates are mainly stabilized by intra-molecular hydrogen bonds that promote greater stability of conformers. The geometrical analysis of the R-SNO group shows that these compounds are more stable in the trans conformation. Calculations of orbital interactions for the brominated intermediates using the method of Natural Bond Orbital (NBO) showed no electronic interactions capable of stabilizing their conformations. The NBO based calculations for the S-Nitrosothiols 9R1, 9R2, and 9R3 show that their conformers are stabilized by the following interactions: n_(O(OR)) ?? ??_(C-C(CO))^*, n_(O(OR))??_((CO))^*, n_(O(CO))??_((CO))^*, n_(O(CO))?? ??_(C14-O15)^*, n_S??_((NO))^*, e n_(O(NO))??_((S-N))^*. NBO results showed that the hyper-conjugative interaction n_(O(NO))??_((S-N))^* is very effective, weakening the ? bond resulting in increasing length of the S-N bond in R-SNO. The strong delocalization n_S??_((NO))^*induces partial ? character to the S-N bond. The weak link ? S-N indicates a strong delocalization of the electron pair of O(NO) due to interaction n_(O(NO))??_((S-N))^* . This interaction is responsible for the elongation of the S-N bond which increases the ability of the compound in releasing nitric oxide. The molecular mechanism of esterification using DCC was investigated by using electronic structure calculations on DFT-B3LYP / 6 311 + G (2df, 2p) level. We described two pathways for the esterification reaction: (i) concerted model (one step leads to the formation of products) and (ii) non-coordinated model (two steps followed by a [1-3] proton migration leads to the formation of products). Results were discussed in terms of energy, electronic parameters and calculated geometries of reactants under study (carboxylic acid, alcohol and DCC) and the reaction product (ester). The activation energy for the concerted model was lower (?G? 27.8 kcal.mol-1) than for the non-coordinated model (?G? 48.9 kcal.mol-1). This step was considered as a determinant of the reaction.

Na síntese dos S-nitrosotióis foram propostas duas rotas sintéticas: a Rota A, com intermediários bromados utilizando DCC (diciclohexilcarbodiimida) como reagente de acoplamento para a esterificação e a Rota B, que realiza a esterificação com cloretos de acila na última etapa. Ambas as rotas propostas tiveram bons rendimentos do produto final (~50%), embora apenas a Rota B levou à formação dos compostos de interesse. Os S-Nitrosotióis, juntamente com os intermediários bromados, foram submetidos a análises espectroscópicas no infravermelho, em solventes de constantes dielétricas crescentes (CCl4, CH3Cl e CH3CN). Para os intermediários bromados observou-se a presença de duas bandas na região de estiramento do grupo carbonila, indicando a existência de duas conformações. Os S-nitrosotióis apresentaram apenas uma banda na mesma região, na maioria dos casos. Efetuamos a busca conformacional para os compostos em estudo e as geometrias das conformações estáveis foram otimizadas em nível de teoria DFT-B3LYP/6-311+G (2df,2p). Os resultados obtidos no infravermelho foram confrontados com os dados teóricos que mostraram uma boa concordância com os resultados experimentais em CCl4 para as moléculas isoladas. Os cálculos efetuados utilizando o efeito do solvente pelo método PCM não mostraram concordância com os resultados experimentais. As conformações de menor energia dos S-Nitrosotióis e dos intermediários bromados são estabilizadas, principalmente, por ligações de hidrogênio intramoleculares. A análise geométrica do grupo R-SNO mostra que esses compostos preferem a conformação trans. O cálculo das interações orbitalares existentes pelo método NBO (Natural Bond Orbital) para os intermediários bromados não mostrou nenhuma interação eletrônica, em destaque, que estabilizasse suas conformações. No caso dos S-nitrosotióis foi possível constatar que seus confôrmeros são estabilizados pelas seguintes interações: n_(O(OR)) ?? ??_(C-C(CO))^*, n_(O(OR))??_((CO))^*, n_(O(CO))??_((CO))^*, n_(O(CO))?? ??_(C14-O15)^*, n_S??_((NO))^*, e n_(O(NO))??_((S-N))^*. Os resultados de NBO mostraram que a interação hiperconjugativa n_(O(NO))??_((S-N))^* é bastante efetiva, enfraquecendo a ligação ? que resulta no aumento do comprimento da ligação S-N nos S-Nitrosotióis. A forte delocalização n_S??_((NO))^*, induz a um caráter parcial ? da ligação S-N. A fraca ligação ?S-N indica uma forte delocalização do par de elétrons do O(NO) devido a interação n_(O(NO))??_((S-N))^* , que é responsável pelo alongamento da ligação S-N, aumentando a capacidade do óxido nítrico ser liberado nos compostos. O mecanismo molecular de esterificação usando reagentes de acoplamento DCC (diciclohexilcarbodiimida) foi investigado por meio de cálculos de estrutura eletrônica em nível DFT-B3LYP/6-311+G (2df,2p). Dois sistemas ou dois caminhos reacionais para a esterificação foram investigados: (i) concertado (uma única etapa leva à formação dos produtos) e (ii) não concertado (duas etapas seguidas de uma migração de próton [1-3] levam à formação dos produtos); Os resultados computacionais foram discutidos em termos dos parâmetros energéticos, eletrônicos e das geometrias calculadas dos reagentes em estudo (ácido carboxílico, álcool e DCC) e do produto de reação (éster). A energia de ativação para o modelo concertado foi menor (?G? 27,8 kcal.mol-1) que para não concertado (?G? 48,9 kcal.mol-1), sendo essa a etapa considerada como a determinante da velocidade da reação.
Keywords s- nitrosothiols
esterification reaction
infrared
conformational study
electronic structure calculations
nbo (natural bond orbital)
s-nitrosotióis
reação de esterificação
infravermelho
estudo conformacional
cálculos de estrutura eletrônica e nbo (natural bond orbital)
Language Portuguese
Date 2014-09-30
Published in REGINATO, Marcelo Mota. Síntese e estudo da estabilidade conformacional de s-nitrosotiós derivados de aines (anti-inflamatórios não esteróidais). 2014. 140 f. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Diadema, 2014.
Research area Química
Knowledge area Ciências exatas e da terra
Publisher Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Extent 140 p.
Origin https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=1609131
Access rights Closed access
Type Dissertation
URI http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/47739

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