Analysis of HIV- type 1 protease and reverse transcriptase in Brazilian children failing highly active antiretroviral therapy (HAART)

Analysis of HIV- type 1 protease and reverse transcriptase in Brazilian children failing highly active antiretroviral therapy (HAART)

Alternative title Análise da protease e transcriptase reversa do HIV-1 em crianças com falha terapêutica em uso de terapia anti-retroviral altamente eficaz (HAART)
Author Machado, Daisy Maria Autor UNIFESP Google Scholar
Fernandes, Silvana Cláudia Google Scholar
Succi, Regina Célia de Menezes Autor UNIFESP Google Scholar
Freire, Wilton Santos Google Scholar
Pannuti, Cláudio Sérgio Google Scholar
Gouvêa, Aida de Fátima Thomé Barbosa Autor UNIFESP Google Scholar
Levi, José Eduardo Google Scholar
Diaz, Ricardo Sobhie Autor UNIFESP Google Scholar
Institution Universidade de São Paulo (USP)
Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Abstract The aim of this study was to evaluate the genotypic resistance profiles of HIV-1 in children failing highly active antiretroviral therapy (HAART). Forty-one children (median age = 67 months) receiving HAART were submitted to genotypic testing when virological failure was detected. cDNA was extracted from PBMCs and amplified by nested PCR for the reverse transcriptase and protease regions of the pol gene. Drug resistance genotypes were determined from DNA sequencing. According to the genotypic analysis, 12/36 (33.3%) and 6/36 (16.6%) children showed resistance and possible resistance, respectively, to ZDV; 5/36 (14%) and 4/36 (11.1%), respectively, showed resistance and possible resistance to ddI; 4/36 (11.1%) showed resistance to 3TC and D4T; and 3/36 (8.3%) showed resistance to Abacavir. A high percentage (54%) of children exhibited mutations conferring resistance to NNRTI class drugs. Respective rates of resistance and possible resistance to PIs were: RTV (12.2%, 7.3%); APV (2.4%, 12.1%); SQV(0%, 12.1%); IDV (14.6%, 4.9%), NFV (22%, 4.9%), LPV/RTV (2.4%, 12.1%). Overall, 37/41 (90%) children exhibited virus with mutations related to drug resistance, while 9% exhibited resistance to all three antiretroviral drug classes.

O objetivo deste estudo foi avaliar o perfil de resistência genotípica do HIV-1 em crianças com falha terapêutica ao tratamento anti-retroviral (HAART). Quarenta e uma crianças (idade mediana = 67 meses) em uso de HAART foram submetidas ao teste de genotipagem no momento da detecção de falha ao tratamento. Foi realizada extração de cDNA de células periféricas mononucleares e amplificação do mesmo (regiões da transcriptase reversa e protease do gene pol) através de PCR-nested. O perfil genotípico foi determinado através do seqüenciamnto de nucleotídeos. De acordo com a análise genotípica, 12/36 (33,3%) e 6/36 (16,6%) crianças apresentaram, respectivamente, resistência e possível resistência ao AZT; 5/36 (14%) e 4/36 (11,1%), respectivamente, eram resistentes e possivelmente resistentes ao ddI; 4/36 %11,1%) apresentaram resistência ao 3TC e D4T, e 3/36 (8,3%) eram resistentes ao ABC. Uma alta porcentagem de crianças (54%) apresentou mutações relacionadas à resistência aos inibidores da trancriptase reversa não-análogos de nucleosídeos. As taxas de resistência e possível resistência aos inibidores da protease foram, respectivamente: RTV (12,2%; 7,3%); APV (2,4%; 12,1%); SQV (0%; 12,1%); IDV (14,6%; 4,9%); NFV (22%; 4,9%); LPV/RTV (2,4%; 12,1%). No total, 37/41 (90%) crianças apresentaram vírus com mutações relacionadas à resistência a alguma droga, sendo que 9% delas tinham vírus resistentes às três classes de drogas anti-retrovirais disponíveis.
Keywords HIV resistance
Antiretroviral therapy
Children
Treatment failure
Language English
Sponsor Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
Date 2005-02-01
Published in Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. Instituto de Medicina Tropical, v. 47, n. 1, p. 1-5, 2005.
ISSN 0036-4665 (Sherpa/Romeo)
Publisher Instituto de Medicina Tropical
Extent 1-5
Origin http://dx.doi.org/10.1590/S0036-46652005000100001
Access rights Open access Open Access
Type Article
SciELO ID S0036-46652005000100001 (statistics in SciELO)
URI http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/2406

Show full item record




File

Name: S0036-46652005000100001.pdf
Size: 217.1Kb
Format: PDF
Description:
Open file

This item appears in the following Collection(s)

Search


Browse

Statistics

My Account